El año 2016, el Hospital de Mar Research se adhirió en el Acuerdo de transparencia sobre el uso de animales en experimentación científica en España. El Acuerdo de Transparencia es una iniciativa de la COSCE (Confederación de Sociedades Científicas de España) que persigue fomentar y coordinar acciones de transparencia y responsabilidad por parte de entidades científicas y empresariales relacionadas con la experimentación con animales. El año 2022, más de 150 entidades españolas estaban adheridas a esta iniciativa. En el marco del Acuerdo de Transparencia, el Hospital de Mar Research asume los siguientes compromisos:
El Acuerdo de Transparencia se ha desarrollado en paralelo a iniciativas parecidas en otros países europeos, de entre las cuales la iniciativa británica fue la pionera el 2014. Al amparo del EARA (European Animal Research Association), los diversos Acuerdos de Transparencia coordinan esfuerzos y acciones por parte de las entidades que se recogen en memorias anuales.
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